特后，企业得知求援是假的，是安洁想让她们和奥斯特等人一同离开。
企业想回去找安洁，却收到防线被攻破，安洁牺牲的消息。
企业因安洁的死而悲伤不已，又愤恨对方的欺骗，未能一同赴死，最终把火炬组织的名字改为余烬，
寓意她们无力照亮人类的前路，只是一群燃尽而苟且的余烬。
奥斯特带着塞壬，舰娘，以及所有幸存者逃离世界α，
X势力一路追杀，为保护零、企业，以及众多幸存者，奥斯特选择断后，最终牺牲，
活下来的塞壬首脑——零重启审判者计划，穿越到各个平行时空的过去，建造试验场，，
引导不同时空的人类发展出更强大的科技，寻找对抗X的希望。
每当X察觉到试验场的存在时，零就会让仲裁机关进行清算，毁灭整个世界，防止被敌人察觉到她们的意图。
舰娘的组织余烬，在这个过程中，不断见证平行时空被毁灭，对零等塞壬的做法愈发不满，
她们没办法接受这种肆意操弄世界，乃至草菅人命而来的救赎，
因理念的分歧，双方走向对立，爆发冲突。
最终，双方的冲突聚焦在一个平时时空——试验场β内，
塞壬以反派的身份，引导着试验场β的发展，舰娘们则协助人类对抗塞壬。
方维降临试验场β后，迅速解锁了心智魔方，能源魔方等技术，
按照任务模组的提示去攻略舰娘，很快就以绝对的优势统一整个试验场β，
期间，他还进行了多种实验，让舰娘和塞壬生出小孩，狠狠震惊了一波世界β的塞壬和舰娘。
塞壬看似和人类与舰娘为敌，实则是人类阵营的一员，
意识到方维的强大，零便亲自出面，和他进行谈判，邀请对方一同对抗高维势力X。
最终双方达成协议，建立同盟，一同对抗高维势力X，
经历一番发展后，积蓄到足够的力量，方维就带着舰娘和塞壬向高纬世界发起战争。
高纬时空是一个可怕的地狱，整个世界都被拟态金属所覆盖了，被X势力所统治。
X势力的背后，是一个疯狂的邪神X，掌
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